[文献资料]三、PSIPRED法

从目前文献引用的情况看，PSIPRED就是现在蛋白质二级结构预测中最流行的方法之一。具体见表10‐6：我们在蛋白质二级结构预测中既介绍了经典的方法，又介绍了现在比较流行的方法，主要目的是让读者对蛋白质二级结构预测有一个比较全面深入的了解。但我们预测的对象与前面两种方法相比要比它们难得多，主要表现在它们预测的蛋白质的长度从22个残基到1303个残基。而David的预测方法的应用对象长度最小的是31残基，最大的为376个残基。我们知道，对蛋白质二级结构预测，其长程作用一直是一个难点，换言之，氨基酸残基越多，则预测难度越大。表10‐6 PSIPRED对CASP3中蛋白质二级结构的预测结果。