[文献资料]一、初始链生成方法

应用从头预测法预测蛋白质天然构象，最初的一步是要产生一系列的初始的构象。而在蛋白质结构预测中，一般采用格子链模型，其基本做法是将空间离散化，即链单元只能取其中某些人为规定格点（lattice site）。格子链模型法主要有方格子模型、金刚石格子链。而在这些链的产生方法一般是自避行走方法（self‐avoiding walks，SA W），其基本思想是高分子链的任意两个和两个以上的单元不能同时占有一空间体积，在格子链模型中，则体现为链单元不能同时占有同一格点。为避免这种现象发生，人们提出了许多链生成方法，如简单偏倚抽样法、跨大步法（strides）、样本复制富集法、二聚法和蛇行法（slithering snake method）法。