录因子中除了DNA结合结构域以外的一个与转录起始复合体相互作用的结构域。含有 30～100个氨基酸残基。有三类结构特性：带有电荷的螺旋结构、富含谷氨酰胺的结构和富含脯氨酸的结构。有的转录因子如血清应答因子（SRF）的结合域不能明确分类，是在转录起始水平上发挥作用。
