电泳时各组分迁移率受很多因素的影响。带电颗粒的迁移率与离子强度的平方根成反比,低离子强度时,迁移速率快,高离子强度时,迁移速率慢,但电泳谱带比低离子强度时细窄。带电粒子在电场中的泳动速度与溶液的黏度成反比,溶液的黏度与其温度有关,因此溶液温度间接影响电泳迁移率。当温度较低时,温度升高,溶液的黏度下降较明显,因此迁移率随温度的升高而增加,但在室温时,温度对溶液的黏度影响较小。凝胶类由于其网状结构而具有分子筛效应,因而具有一定的排阻作用,是电泳和排阻双重作用,因此分离效果更佳。