一、基于配体活性小分子共同特征的药效团

从一系列活性小分子出发，构建基于配体结构共同特征的药效团步骤如下：1 ﹒活性小分子的选取。构建药效团模型的第一步就是选取恰当的活性小分子。例如，如果想构建一个肾上腺素β 1受体拮抗剂的药效团模型，就必须事先收集一系列具有肾上腺素β 1受体拮抗活性的小分子作为训练集。分子叠合得到的药效团模型往往不是最优的，可能还需要根据自己的经验和其他实验或计算的结果对药效团模型作进一步的修正，比如加入排斥体积。药效团构建最终的目的是为了使用得到的药效团模型指导实验化合物的改造，或者使用药效团模型搜索化合物数据库，寻找骨架新颖的先导化合物分子。