要从转染的细菌中提取重组质粒DNA,首先需进行细菌的收获和裂解,细菌的收获可通过离心来进行,而细菌的裂解则可以采用多种方法中的任意一种,这些方法包括用非离子型或离子型去污剂、有机溶剂或碱进行处理及加热处理等。它是利用共价闭环质粒DNA和染色体DNA变性、复性的特性不同,有效去除染色体DNA。质粒DNA的大部分氢键也断裂,但超螺旋共价闭合环状结构的两条互补链不会完全分离,当用含SDS钠盐的醋酸钾高盐缓冲液快速中和时,变性的质粒DNA又恢复到原来的构型,保存在溶液中。溶液中的质粒DNA则可通过乙醇沉淀浓缩回收。
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