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三、SAGE的生物信息学

SAGE作为基于序列的基因表达测定平台,利用特定的DNA序列作为生物信息,这是SAGE最主要的优点。标记序列同其他数据库内的参考序列的比较。标签提取功能包括读取来自测序文库的文本文件中的双联标签序列。在这些序列的固定酶切位点作标记,经过长度筛选再与已知序列列表比较,若已存在则当前序列将被删除。美国国家生物信息中心的Uni Gene数据库和南非国家生物信息学研究所的序列标签普查数据库都提供网上数据咨询服务。作为美国国家癌症研究所人类癌症基因组计划的一部分,这个网上资源提供了一种有效的工具用于浏览分析40个SAGE文库的SAGE标签。

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——《药物基因组学》
书名:《药物基因组学》
栏目:药物基因组学 > 第二篇 药物基因组学的研究方法 > 第五章 基因表达连续分析
作者:姜远英
参编:
页码:105-107
版本:1
出版时间:2006-03-01
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