[文献资料]五、分子系统学数据的处理与分析

有关分子系统学方面的蛋白质和DNA序列分析主要是构建序列进化树。构建序列进化树的主要步骤是首先确定所要分析的生物类群，选择该类群中相关亚类群的一些代表种类。确定所要分析的目的生物大分子或它们的组合。设法获得它们的序列数据或其他相关数据。比对、建立取代模型，建立进化树及进化树评估。免疫学和核酸杂交方法直接提供相似性数据，而序列、限制性酶切图谱和等位基因数据必须经过转换才能成为距离数据。除了上述介绍的软件包以外，还有其他一些系统发育程序，这些程序包括Hennig86 FastDNAml、MacClade、BI ......