[文献资料]二、针对位点的整理

若位点的缺失率较高（如＞ 5% ） ，后续分析中往往需要将其移除。但对于一些等位基因频率较低的位点（如＜ 5% ） ，缺失率超过1%即可以考虑将其移除。如果GWAS芯片中出现位点偏离HWE ，往往意味着该位点基因分型或密度数据转化为基因型时出现了错误，需要将其删除。考虑到需要检测的位点有数十万之多，多重检验水准通常取比较小的值（如α ＝ 10 －。当然，对所删除的位点或个人往往还需要进一步手工审核。对于SNP的质控，满足如下条件的位点将被移除：性染色体上的位点、应答率＜ 95% 、 MAF ＜ 5%或HW ......