虽然三羧酸循环被认为是氧化代谢的一部分,但是它本身并不直接利用氧气,仅在最后的分解代谢反应中存在氧气分子(O2)的直接消耗。在氧化反应的早期阶段,几乎所有的能量(来自于碳水化合物、脂肪及其他食物分子)都以高能电子的形式储存起来,由NADH和FADH2所携带,通过镶嵌在线粒体内膜上的呼吸链与O2结合。在一个典型的细胞中,一个正在呼吸的线粒体的跨内膜质子动力势为180~190mV(内侧为负电荷),这由160~170mV的膜电位及0.3~0.5 pH单位的pH梯度构成(1个pH单位的△ pH所产生的效应等同于6 ......