目前还没有一套完全成熟的理论来指导如何选择一段最有效的dsRNA使某个特定基因沉默,下面所列的原则很多是基于实验研究的成功结果。最经典的是Elbashir等提出的原则:1 ﹒从靶基因cDNA起始密码的下游50~100碱基处开始选择靶位点。4 ﹒将选取的序列和相应的基因组数据库进行比较,排除与其他编码序列/表达序列标签(ex pressed sequence tag,EST)同源的序列,以确保靶基因只是单个基因。另外,小发夹RNA(shRNA)中正反靶序列的选取参照siRNA的原则,不同的是shRNA的序列 ......