三、转录因子结合位点相关数据库：TRANSFAC、JASPAR、SELEX_DB

随着生物实验所验证的转录因子结合位点的不断积累，目前出现了专门收集TFBS相关信息且各具特色的数据库，详见表7-10。TRANSFAC是真核生物转录调控信息的数据库，包含转录因子，转录调控关系以及转录因子结合位点等相关信息，涵盖的物种有酵母、拟南芥、线虫、果蝇、大鼠、小鼠、人等。TRANSFAC 11.3中，共收集了10 018个转录因子，以及20 431个转录因子结合位点，为TFBS预测算法提供了高质量的训练集和验证集。 ......

——《生物信息学理论与医学实践》

书名：《生物信息学理论与医学实践》

栏目：生物信息学理论与医学实践 > 第七章转录调控的信息学分析 CHAPTER 7 BIOINFORMATICS ANALYSIS ON TRANSCRIPTION REGULATION > 第三节转录因子结合位点的信息学研究

作者：李霞

参编：张岩，陈秀杰，陈丽娜，王艳秋，刘磊

页码：306-311

版本：1

出版社：人民卫生出版社

出版时间：2013-01-01

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