通过衣原体基因组之间的比较,不仅可以揭示衣原体种的起源,还可阐明某些衣原体的特殊生物学特性。完整的毒素基因存在于猪衣原体基因组中,但不存在于流产嗜衣原体、Cpn、猫嗜衣原体、Cps和兽类嗜衣原体中。副衣原体拥有Ⅲ型分泌系统、InC蛋白、衣原体蛋白酶样活性因子(pc0916),但在阿米巴副衣原体基因组中不存在CADD(衣原体蛋白相关死亡结构域)、梭状芽胞杆菌样毒素,而富含半胱氨酸蛋白酶以及自动转运蛋白PmpD等编码基因。副衣原体基因组远大于Ct、Cpn、Cps等,主要原因是其他衣原体生活在相对恒定的环境中( ......