第五节 蛋白质组学数据分析工具

对蛋白质组数据进行解析和进一步的功能分析是蛋白质组研究的一个重要组成部分，对特定实验产出的生物质谱数据的解析可以获得蛋白质的鉴定、定量和修饰等一系列生物学信息。图14-13是基于生物质谱的蛋白质组数据的基本分析流程。因为数据分析的各个环节均存在部分假阳性，需要在肽段以及蛋白质水平分别进行质控，以获得高度可靠的鉴定结果。进一步根据被鉴定蛋白质的肽段等相关信息，利用对应的质谱数据进行定量，从而获得不同样品间的蛋白质差异表达信息。该软件包重点关注定量结果的可视化方面，主要的分析模块包括数据库检索、丰度比的聚类、 ......