六、序列编辑

经过测序后获得的病毒核酸序列，在进行耐药分析以前，需要进行初步的质量评价、拼接、混合碱基判读、序列清理和质量控制等一系列流程。在基因型耐药检测中，常用的软件包括序列质量评价软件、序列拼接和编辑清理软件及用于质量控制的系统进化树分析软件。发现可疑的碱基时，应在Sequencher项目文件中的序列图谱中进行确认，需修改的碱基应在Sequencher文件中进行修改，完成一轮校正过程后由Sequencher软件重新输出校正后的序列后再次进行比对。根据序列研究目标的不同，这一过程可能会循环数次，直至Sequench ......