脊椎动物结构虽较为复杂,但所有器官系统都具有统一的结构和功能,这些器官系统的发展,都遵循着严格的规律性。有些特征通常是存在于数个纲中,甚至是整个亚门,因此脊椎动物进化的线索是明确的。脊椎动物比较解剖学主要研究同源器官(有相似的解剖结构、与动物体有相似的位置关系、有相同的胚胎起源)和同功器官(不同动物的器官在功能方面相似,有时在外表形态也相似,但是器官内部结构、胚胎起源和发生是完全不同的)的进化。大多数夜间活动的动物都有大的眼球,例如猫科的羊猞猁是大眼球,猫的眼球也很大,猫头鹰眼球有它的头的1 / 3大小, ......