三、分子流行病学

群体生物学、进化生物学与感染病学、微生物学交叉和融合的一个重要领域是分子流行病学（molecular epidemiology），包括鉴定病原体（病毒、细菌、真菌和原虫）的种系发生关系（phylogenetic relationships）以及有关毒力、疫苗相关抗原和药物抗性的基因及其附件。虽然许多病原体的种群基因结构在大的时间和空间尺度上属随机交换型，但其引起暴发流行的菌株的种群基因结构通常是克隆化的〔 53 〕。其次，有关病原体种群基因结构的知识有助于理解在宿主施加免疫选择性压力下（天然的或疫苗诱导的 ......