逆转录病毒逆转录酶的整合酶蛋白部分全长近300个氨基酸,每个单体有3个结构域。结构域之间的连接十分复杂,利用X线晶体衍射技术已获得的整合酶全长的三维结构。并通过对结构域肽段的研究也可间接获得对整合酶的结构的信息。MLV的整合前复合体的整合限制作用依赖于一个89个氨基酸的未知细胞蛋白,故命名为“自身整合屏障蛋白”(barrier‐to‐autointegration protein)。其他逆转录病毒整合前复合体是否具有相似的阻止自身整合的机制现在还不清楚,但原核重组系统如噬菌体λ DNA的整合和转座子Mu ......