第二节 抗原‐抗体复合物的结构优化

抗原‐抗体相互作用复合物结构是合理判定抗原表位、抗体合理改造与设计的基础。基于计算机辅助分子模拟获得抗原‐抗体复合物结构的流程如下：以构建TNF与其功能抗体Z12相互作用复合物结构为例，说明抗原‐抗体复合物结构模拟过程［ 2 ］。以Jones等［ 5 ］获得的hTNF‐α晶体结构（PDB库号：1tnf）为模板，选择与构建抗体Z12可变区空间构象一致的力场参数，对其赋予氢原子坐标，从理论上构建hTNF‐α结构，并借助已有的试验结果对其活性表位进行空间定位（图9‐。 ......