一、基准序列（序列模式）：标纹、标志、指纹和位点

在生物信息学中，这种相对保守的序列片段统称为基准序列（consensus sequence）或序列模式（pattern）。为此已收集整理了文献中发表的序列模式，如Bairoch建立的PROSI TE蛋白质模式和位点数据库，它按通用命名原则逐项列举位点和模式，包括转录后修饰位点、结构域、DNA或RNA结合蛋白、酶（氧化还原酶、水解酶、转移酶、裂合酶、异构酶、连接酶等）、电子转运蛋白、其他转。随着蛋白质序列库的增大，由蛋白质的平均氨基酸组成推算的蛋白质位点的期望个数（E）将接近于氨基酸序列完全随机化所得到的期 ......