方案六 单位点序列分型（Single-locus sequence typing）

本方案以金黄色葡萄球菌spa分型为例，说明单位点序列分型的应用。金黄色葡萄球菌spa分型引物如下：Up：5 ’-AGACGATCCTTCAGTGAGC-3 ’。扩增条件一般为：50 μ l以上反应体系（考虑产物测序），94℃5min。人工分型在选取分型分析的基因片段完成以后，从5 ’端按每24bp进行分段，根据网站提供的数据，首先对每个24bp的数据进行编号，直到在数据库中没有相应的编号为止。然后再根据每个24bp片段对应的编号所产生的编号组合，参照数据库，来确定样本的spa型别。 ......