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[文献资料]第二节 全基因组关联研究流程

目前的GWAS多采用两个阶段的设计:首先用覆盖整个基因组的高通量SNP芯片对一批样本进行分型,然后筛选出差异最显著的SNP (如P < 10-8 )供第二阶段进行扩大样本验证。GWAS两阶段研究设计减少了基因分型的工作量和花费,同时通过重复实验降低了研究的假阳性率。GWAS的整体过程比较复杂,其大致流程如下:通过高通量芯片检测样品的分型信息,得到原始数据。我们将符合芯片要求的DNA样品与高通量的SNP分型芯片进行杂交,再通过特定的扫描仪对芯片进行扫描,将每个样品所有的SNP分型信息以数字形式储存于计算机中 ......

——《肿瘤分子流行病学》
书名:《肿瘤分子流行病学》
栏目:肿瘤分子流行病学 > 第四章 全基因组关联研究
作者:沈洪兵
参编:林东昕,魏庆义,于典科,马红霞,王美林
页码:53-58
版本:1
出版社:人民卫生出版社
出版时间:2014-11-01
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