链置换反应是指某些DNA聚合酶在延伸新链的过程中如果遇到下游DNA链,可以继续延伸反应并同时将下游双链剥离而产生游离的单链。缺口依赖的链置换反应是通过某种方法(如限制性内切酶)在双链DNA的一条链上产生缺口,无5 ’ - 3 ’核酸外切酶活性的DNA聚合酶从缺口处3 ’端开始延伸反应,同时将下游的旧链剥离,因链延伸而被封闭了的缺口可以重复产生,使得切割-延伸-链置换的过程重复进行(图8 - 2 -。由于缺口延伸后重新产生了一个HincII识别位点,并且此识别位点始终处于半修饰状态,所以产生缺口与聚合、置换 ......