致病基因定位于15q15 ﹒ 121 ﹒ 1,称CANP3基因,由24个外显子和23个内含子组成,编码产物是一种存在于细胞质中的由822个氨基酸残基组成的肌肉组织特异性蛋白酶cal‐pain3,又称钙离子激活中性蛋白酶3(calciumactivatedneu‐tralprotease,CANP)。是一种细胞内非溶酶体半胱氨酸蛋白酶,它是目前已知的LGMD2各型致病基因编码产物中唯一的酶蛋白。目前已知的致病性CANP3基因突变有97种,包括4种无义突变,32种缺失/插入突变,8种衔接点突变,53种错义突变 ......