模块是指彼此协同工作从而执行一致功能并在物理上或者功能上紧密联系的一组生物分子(节点)。考虑到很多真实网络当中同时具备模块性、无标度性以及局部高连接性的特征,学者提出节点集整合成为网络的过程类似一个循环迭代的过程,从而使网络成为一个层次性网络,见图12-4(A1)。研究显示,不同的生物分子网络往往表现出相似的性质。大部分的真实生物网络如代谢网络、蛋白质互作网络、蛋白质结构域网络等都是无标度网络,其网络平均聚类系数都比具有同样大小和连通度分布的随机网络更高,且聚类系数均值正比于连通度的倒数,从而表明层次化是 ......