伤寒杆菌经口入胃,未被胃酸杀灭的细菌进入小肠,侵入肠道淋巴组织,由淋巴管进入血液,引起第一次菌血症,此阶段为潜伏期,临床无症状。继而病菌随血液进入肝、脾、骨髓等脏器内,未被吞噬细胞所消灭的病菌继续生长繁殖,再次进入血循环,引起第二次菌血症,此时血液内病菌量多,且释放内毒素,开始出现临床症状,即相当于疾病初期。尔后病菌继续随血流到全身各脏器,其中以肠壁的集合淋巴结、肝脾、骨髓等受损显著。在胆囊内的细菌大量繁殖后,向肠腔排出,更加重了肠壁的损害,此期相当于病程的第2~3周。其他组织如肠系膜淋巴结、肝、脾、骨髓 ......