凝血酶属于丝氨酸蛋白酶家族成员,是研发抗凝血药物的重要靶标。通过比较凝血酶的天然底物纤肽(fibrinopeptide)与三肽抑制剂D-Phe-Pro-Arg同酶活性部位的结合模式,提示D-Phe-Pro-Arg中的D-构型苯丙氨酸残基处于纤肽A的环套,进入了凝血酶的大而远的S3结合腔内,D-Phe的苯环占据了S3腔的疏水部位。图7.6化合物15~20的结构式、与凝血酶结合的解离常数,以及化合物之间热力学特征的差异。