生物信息学的重要功能是查询搜索数据库,获得数据后进行一系列的分析,以获得需要的信息或发现新的信息。数据库搜索在生物信息学中有特定含义,它是指通过特定的序列相似性比对算法,找出核酸或蛋白质序列数据库中与检测序列具有一定程度相似性的序列。搜索序列后采用合适的生物信息学软件进行分析,以期发现新序列的生物学特性,这将是本章着重介绍的重要内容。