大多数真核生物的基因为不连续基因(discontinuous gene),或称为断裂基因,基因的编码序列在DNA分子上是不连续的,被非编码序列所隔开。编码蛋白质的序列称为外显子(exon),是一个基因表达为多肽链的部分。非编码序列为内含子(intron),又称插入顺序。内含子只转录,在前m RNA时被剪切掉,不能被翻译成多肽链,剪切后的编码序列连接形成成熟的m RNA,并翻译成蛋白质。真核生物中也有些结构基因没有内含子,如组蛋白基因、干扰素基因等,它们大多以基因簇形式出现。