给药途径大部分为静脉输注,仅有少数为口服给药。静脉输注应在皮肤、黏膜切开前0.5 ~ 1小时内或麻醉开始时给药,在输注完毕后开始手术,保证手术部位暴露时局部组织中抗菌药物已达到足以杀灭手术过程中沾染细菌的药物浓度。万古霉素或氟喹诺酮类等由于需输注较长时间,应在手术前1 ~ 2小时开始给药。有些病例术前使用一种抗菌药物,术后在没有临床和实验室检查依据的情况下立即更换为另一种抗菌药物,反映出用药的随意性。