双杂交系统由多种成分构成(含诱饵基因、猎物基因和报告基因的质粒,以及一体化的报道蛋白),最初用来确定和估测配对的单个蛋白质间相互作用的亲和力。由于证实了基本双杂交系统在解决双体问题的有效性,人们的兴趣转移到扩展双杂交系统应用范围的方面,使其能够解决更复杂的、包含更多系统成分的相互作用。