自主神经系统的功能在于调节心肌、平滑肌和腺体(消化腺、汗腺、部分内分泌腺)的活动。通常,交感神经中枢和副交感神经中枢的活动是对立的,也就是说当交感神经系统活动相对增强时,副交感神经系统活动就处于相对减弱,但是在某些情况下,也可出现交感和副交感神经系统活动均增强或减退,但两者间必有一个占优势。而交感神经系统和副交感神经系统在外周作用方面却协调一致,例如唾液腺的交感神经和副交感神经支配都有促进分泌的作用。其整个系统的活动主要在于保护机体、促进消化、积蓄能量以及加强排泄和生殖功能等方面,例如,心脏活动的抑制,瞳孔缩小避免强光的进入,消化道功能增强以促进营养物质吸收和能量补给等。
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