数据库搜寻技术在药物设计中广为应用,该方法发现的化合物大多可以直接购买得到,即使部分化合物不能直接购买得到,其合成路线也较为成熟,可以从专利或文献中查得,从而可以较快地进入生物测试阶段,大大加快了先导化合物的发现速度,缩短了药物开发的时间。但是全新药物设计法设计出的分子有时会是一些“超级分子”,虽然能和靶点很好的结合,但由于含有太多的原子种类或过多的化学键类型,无法满足类药性(如由C .由于全新药物设计出现的时间不长,仍不完善,有待进一步开发。