在生物合成基因簇全克隆完成后,将克隆的基因簇插入E ﹒ coli复制子,含抗生素生物合成基因簇的质粒可以在E ﹒ coli复制,表达,产生相应抗生素。生物合成基因簇全克隆完成后,通过使用生物信息学的手段和放线菌遗传试验的分析和验证可以亚克隆基因簇中的各种模块和结构域,使用这些模块和结构任意组合会产生母核与支链不同、分子量各异的、庞大的化合物库。下面以最成熟的红霉素为例说明系列组合化合物的建立(图6‐。实际得到48个新化合物,尽管同理论上的化合物数目有一定差距,但是可以想像,此方法在组合化合物库构建上有着极其诱人的潜力!
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