[速览]三、与保守的基序和图形数据库比较判断功能

对于那些与数据库中已知功能蛋白质无同源性的序列或找到同源性的蛋白质功能为未知时，我们可与保守的基序和图形数据库比较判断其功能。基序数据库最为著名的是PROSITE，值得注意的是结果可能存在假阳性。质谱数据库查询软件的应用与评价蛋白质组研究的技术平台则主要由双向凝胶电泳（two‐dimensional gel electrophoresis，2‐DE）、质谱技术（mass spectrometry）和生物信息学等技术构成。这种核查逐步遍及整个蛋白质，就完成蛋白质磷酸化鉴定。