[文献资料]二、统计分析软件PLINK

PLINK是一款广泛应用的免费、开源的遗传关联分析工具集，由美国哈佛大学开发，旨在用有效的计算方式进行常规的及大规模的遗传分析。PLINK的分析功能强大，可进行数据处理和统计描述、关联分析、频率检测、哈迪温伯格检验、多重检验校正及基因交互作用分析等。在病例-对照研究中进行关联分析采用以下命令：其中mydata为用户所准备的PED和MAP文件的文件名（注PED和MAP文件名应当相同) ， assoc为关联分析命令,可用来对数百万或数千万的SNP开展关联分析。PLINK关联分析默认采用的模型是等位基因模型，如果需要采用其他模型需将- - assoc命令进行替换。其他单个模型分析的命令如下： - - dominant显性模型分析。