第三节 蛋白质同源模建技术

研究蛋白质的结构，有助于了解蛋白质的功能，了解蛋白质的作用机制以及了解蛋白质与其他分子之间的相互作用，这对于生物学、医学和药学都有非常重要的影响。而且，通过分析蛋白质的结构，确认结构域，为设计新的蛋白质或改造已有蛋白质提供可靠的依据，同时为新的药物分子设计提供合理的靶分子及结构。同源模型化方法的主要思想是：对于一个未知结构的蛋白质，首先通过同源分析找到一个已知结构的同源蛋白质，然后，以该蛋白质的结构为模板，为未知结构的蛋白质建立结构模型。将目标蛋白质的序列与模板蛋白质序列进行比对，使目标蛋白质的氨基酸残基与模板蛋白质的残基匹配，进而为下一步给SCR（保守区域）赋坐标做好准备。