选择性固定液是一类特殊的固定液,主要用于异构体的分离分析,它在医药、农药中具有重要的意义。选择性固定液主要有过渡金属混合物、液晶、手性化合物及有机盐类等。过渡金属常用于分离顺反异构体,液晶特别适合分离几何异构体和位置异构体的混合物。气相色谱中手性固定相一般可以分为三类:手性氨基酸衍生物(氢键型手性固定液)。冠醚作为气相色谱固定液是按照低分子冠醚-高分子冠醚-高分子液晶冠醚的趋势发展的。例如:硝酸银-聚乙二醇固定液可以分离不饱和酸的顺反异构体。