PCR反应产物的特异性由一对上下游引物所决定。引物设计和选择目的DNA序列区域时可遵循下列原则:①引物长度约为16~30bp,太短会降低退火温度影响引物与模板配对,从而使非特异性增高。引物5′端对扩增特异性影响不大,可在引物设计时加上限制酶位点、核糖体结合位点、起始密码子、缺失或插入突变位点以及标记生物素、荧光素、地高辛等。引物不与模板结合位点以外的序列互补。所扩增产物本身无稳定的二级结构,以免产生非特异性扩增,影响产量。一般PCR反应中的引物终浓度为0.2~1.0 μ mol/L。利用紫外分光光度计,可精确计算引物浓度,在1c m光程比色杯中,260nm下,引物浓度可按下式计算:X(mol/L)= OD260/A。
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