在聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)中,缓冲液的选择,首先应考虑被分离物质在此系统中的溶解性、稳定性及生物活性,同时要考虑分辨率和电泳时间长短。缓冲溶液的pH值、离子强度及离子组成对电泳均有影响。在PAGE中有多种缓冲系统需要考虑,如样品缓冲液、凝胶缓冲液(包括浓缩胶缓冲液和分离胶缓冲液)以及电极缓冲液(包括阳极缓冲液和阴极缓冲液)。先导离子只存在于样品和凝胶缓冲液中,反向离子则存在于凝胶缓冲液和电极缓冲液中,因此样品缓冲液和凝胶缓冲液可采用相同的缓冲系统,只是离子强度不同。