蛋白质磷酸化过程是通过磷酸酶调节的。蛋白磷酸酶可以产生磷酸化,对下游激活物特异性的调节,蛋白磷酸化和去磷酸使得调节过程完整灵活。蛋白磷酸酶有四种:蛋白磷酸酶。1、蛋白磷酸酶‐2A,蛋白磷酸酶‐2B和蛋白磷酸酶‐2C。蛋白磷酸酶‐2C结构不同,在组织中分布少。同蛋白激酶一样,蛋白磷酸酶有重要的生理调节作用。蛋白磷酸酶‐2B是脑中的Ca2 +结合蛋白,Ca2 +和cAMP可以使其活化。组织特异性的靶单位能够把蛋白磷酸酶局限到重要的细胞内结构上。