雌激素与女性生殖系统和第二性征的发育与保持有关,雌激素导致阴道、子宫与输卵管生长发育,并导致乳房增大。雌激素也间接地影响骨骼成形和泌尿生殖器结构的松紧度与弹性,引起长骨骨骺变化,从而导致青春期急速发育生长和停止,腋毛与阴毛生长,以及乳头和生殖器的色素沉着。雌激素影响钙质和磷质的新陈代谢,并有助于保持正常的骨骼结构。雌激素长期不足时,使用雌激素药物也许可以改变相关的骨质变化。与雌激素缺乏相关的中度和严重血管舒缩功能障碍,骨质疏松的预防和治疗,降低冠心病发病率及与之相关的绝经后妇女的死亡率,萎缩性阴道炎和萎缩性尿道炎,女性低雌激素血症。
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