三、单位点序列分型（Single-locus sequence typing，SLST）

单位点序列分型是根据病原体基因组中一个位点的DNA序列进行分型。由于SLST方法的DNA序列长度更为有限，这段序列的多态性必须更为丰富，才能保证有较好的分型能力。较常见的单位点序列分型如用于对金黄色葡萄球菌进行分型的spa分型方法，该方法是利用葡萄球菌A蛋白基因spa序列的多态性实现分型的。芯片上能够包含20 000个长度为300～800bp的基因组序列或PCR产物片段，甚至多达600 000个长度为50～70bp的寡核苷酸片段。随着微生物的继续进化，芯片的组成序列也要随之进行更替，如增加特征性的毒力因子 ......