消化道的全长约9m,从口腔到肛门均有细菌定植。定植于口腔的微生物除细菌外,还有真菌、支原体、原虫和病毒。肠道细菌在整个肠道中均有分布,主要集中于结肠中。胃酸酸性强,可杀死大部分细菌,但仍有幽门螺杆菌、链球菌、葡萄球菌、乳酸杆菌和酵母样真菌等抗酸性菌存活。从十二指肠到回肠末端,随着肠道内容物pH逐渐升高,总菌数和活菌数逐渐增加。浓度为10 9~10 12 CFU/ml,主要为厌氧菌,双歧杆菌(10 8~10 11 CFU/ml)、类杆菌、乳酸杆菌(10 4~10 9 CFU / ml)占绝对优势,作为优势菌 ......