五、有空隔配准的BLAST 程序与位置特异的迭代BL AST 程序

各种BLAST可将蛋白质或DNA检索序列与蛋白质或DNA数据库比较。与成对序列比较一样，也可以进行寻找矩阵和简单序列的最优全局配准、寻找完全矩阵与序列的一个片段的最优配准及寻找矩阵和序列的局部最优配准。多重配准构建:为了从BLAST的输出产生多重配准,可以收集与检索序列配准的E值低于一个阈值（如默认0 ﹒。例如不立即将全部的得分超过预定阈值的成对配准合并成一个多重配准，而是将其中最显著的配准用于构建一个初始多重配准及相关的位置特异的分值矩阵，并用其重新计分和重新配准数据库中低得分的序列。新的有空隔配准的B ......