在进行进一步的蛋白质组学分析之前,复杂样品的分级分离是非常重要的一步,尤其是鉴定那些来自复杂混合物的低丰度蛋白质。任何能够减少样品复杂性的实验都能够极大地提高被成功鉴定的低丰度蛋白的数量。在MS鉴定蛋白之前,反相色谱分析(RP chromatography,RPC)被普遍地应用于消化肽段的分级分离。亲和色谱分析被广泛地用来进行膜蛋白的分级分离。如果亲和配体或者免疫亲和配体比如凝集素或者抗体用来进行分离提纯,众多去垢剂中的任何一种添加进流动相通常都不会造成疏水性膜蛋白的结合以及提取的显著减少。 ......