第五章 分子进化分析CHAPTER 5 MOLECULAR EVOLUTION ANALYSIS

进化是一种不断改进的过程，物种起源》中这样描述:“每个生物每时每刻都在为生存进行反复的斗争,如果在复杂甚至多变的生存条件下该生物仍然能够不断改进自己，那么其将有较大的生存可能性并被自然选择所保留。尽管自然选择在形态形成和行为进化方面似乎普遍存在,但在某些基因和基因组进化中所起的作用也有其他看法。分子进化的中性学说认为，种内和种间大多数可见差异不是自然选择，而是适合度很小的随机突变的固定所决定的。由于一个序列的氨基酸无替代概率为e-rt，因而两个序列同源位点均无替代的概率是：q =（e-rt）2 = e-2 ......