HLA基因区域位于第6号染色体的短臂上,包含了约100个紧密相连的基因区域,长2分摩(centimorgan,CM,分摩是基因交换率在基因图上的图距单位,重组频率为1%的两个连锁基因间距离为1分摩),约4000kb,分为3个区域。HLA系统包含组织相容性位点外,还包含HLA‐Ⅲ类基因编码,即经典补体途径组分中C2和C4及补体替代途径的裂解素B因子(Bf)。该区域还编码肿瘤坏死因子α和β(TNF‐α和TNF‐β,现在也被称为淋巴毒素LT‐A)、热休克蛋白70(HSP‐。另外编码淋巴毒素(LT‐B)和NF‐κ ......