二、短序列数据格式转换

下载得到的以. sra结尾的文件是一个压缩格式的文件，无法直接阅读，使用前需要通过软件将其转换为. fastq等格式，这就用到了SRA Toolkit中的fastaq-dump命令。进行短序列格式转换主要分为以下四步。这样在使用该程序的时候就不用输入该程序的绝对路径（在文件～/ . bash_profile文件中添加export PATH = / sratoolkit . 2.1.10-centos _ linux64 / bin：$ PATH），这样用户就可以在控制台中使用sratoolkit的各项工具 ......

——《生物信息学理论与医学实践》

书名：《生物信息学理论与医学实践》

栏目：生物信息学理论与医学实践 > 第六章新一代测序数据分析 CHAPTER 6 NEXT-GENERATION SEQUENCING DATA ANALYSIS > 第五节研究实例：基于新一代测序技术的癌症组学研究

作者：李霞

参编：张岩，陈秀杰，陈丽娜，王艳秋，刘磊

页码：270-271

版本：1

出版社：人民卫生出版社

出版时间：2013-01-01

▲ [文献资料]泮托拉唑Pantoprazole

▼ [病理学]第五节颅内海绵状血管瘤（cavernous angioma）