微生物基因组学以微生物基因组为主要研究对象,它的主要研究内容涵盖两个方面:一是微生物基因组的测序。二是以计算机网络为主要研究环境,以生物信息学软件为主要研究工具,对完成测序的微生物基因组序列进行查询、搜索、比较、分析,对各段DNA序列的生物学意义进行注释。重复序列、插入序列、转座子、致病岛、复制原点等也是微生物基因组中的特殊序列,具有特定的生物学意义。直系同源蛋白聚类分析是通过对蛋白序列的比对分析来确定它们的谱系发生关系的分析方法,是使用生物信息学技术确定基因功能的非常有用的方法。 ......